画家柯九思尤其擅长绘画墨竹，其中墨竹发源于唐代，至元代已经成为了最为盛行的题材，在元代中后期则擅长绘画墨竹的人才较多，其中柯九思在当时也颇具影响力，柯九思所绘画的墨竹别开生面，并将中国古代的书法融于画法之中，讲究"写干用篆法，枝用草书法，写叶用八分或用鲁公撇笔法"。
柯九思笔下的墨竹"各具姿态，曲尽生意" 新竹拔地而起，一片枝茂叶盛欣欣向荣，而老竹则稍稍倚斜，枝叶扶疏劲节健骨，而幼竹奋发向上，稚叶初长并充满朝气。正和元代元朝国子祭酒刘铉所赞叹"晴雨风雪横出悬垂;荣枯稚老各极其妙"另外，在明朝的刘伯温、清朝乾隆皇帝对柯九思的墨竹都有题咏之作。
其中柯九思的《清閟阁墨竹图》现藏于故宫博物院，这幅图是柯九思至元戊寅留宿清閟阁特为倪瓒所作。在图中则有竹两竿怪石一块，以书法撇法写竹叶并用浓墨拖笔渲染为节。其中两竹一为繁盛而另一为稀疏，一为老干而另一为新枝。
柯九思作画的画风学文同而又自出新意，并且更加讲究笔墨和画面的效果，常常使用对比手段以创造出清新的视觉体验，根据资料表明柯九思画竹多采用半生不熟的纸张以发挥其作画特长。
如今细数柯九思的传世绘画作品只有近三十件，但因为他的名声很大所以伪作较多，如今尚存的作品有藏于故宫博物院的《清閟阁墨竹图》和上海博物馆的《双竹图》等，同时还著作有《竹谱》一书，柯九思既擅长诗词，其诗词庄严瑰丽有《丹丘生集》辑本。但他终生仕途坎坷晚年间出家修道寄情山水
